细胞凋亡的一个显著特点是细胞染色体DNA的降解，这种降解非常特异并有规律，所产生的不同长度的DNA片段为180 bp-200 bp的整数倍，表现为琼脂糖凝胶电泳中呈现特异的梯状Ladder图谱。本试剂盒采用TUNEL法，应用末端脱氧核糖核苷酸转移酶（Terminal Deoxynucleotidyl Transferase, TdT）在凋亡细胞中断裂DNA的3´-OH末端催化掺入594-dUTP，594-dUTP标记的DNA可以用荧光显微镜直接观察或者用流式细胞仪定量。TUNEL法可以选择性的检测凋亡细胞，而非坏死细胞或因辐照和药物治疗而造成的DNA链断裂的细胞。标记的dUTP（如地高辛-dUTP、生物素-dUTP），可以直接进行原位检测，是一种更快速、直接的检测手段。